《农政全书》中还记述了徐光启对白蜡虫和蝗虫的研究。他是我国历史上详细记述白蜡虫生活习性和蝗虫生活史的第一人。
由于商品经济的发展，明代经济作物的产区、种类都有增加，技术得到进一步提高。中国古代经济作物中与纺织业密切相关的棉花、桑、麻等在明代发展较为迅速。棉花种植已“遍布于天下，地无南北皆宜之，人无贫富皆赖之”[47]。主要产棉区长江三角洲、东南沿海及黄河中下游地区，很多农民都改以植棉为主业。在棉花浸种、播种、施肥以及间苗、掐尖等生产技术上，也已总结出不少经验。
在桑麻的种植方面，江苏、浙江一带及四川的阆中等地，都是这时期桑麻发展较兴旺的地区。为了增加桑叶的产量，一些地区采用桑树密植法，徐光启《农政全书》还提到过南方与天争时的桑树速成栽培技术：“多种早桑，壅得肥，养得早，叶便可早成，脱了梅天也。”[48]在养蚕技术上，一些地区总结出了培育优良蚕种和防治蚕病的经验，如宋应星的《天工开物·乃服》介绍说：“今寒家有将早雄配晚雌者，幻出嘉种”，又言“若将白雄配黄雌，则其嗣变成褐茧”。早雄配晚雌即是将一化性蚕的雄蛾和二化性蚕的雌蛾杂交，使蚕种变异，育出合乎需要的新蚕种。同样，将黄茧蚕蛾和白茧蚕蛾杂交后，育出的下一代是褐茧蚕蛾。关于病蚕的发现，《天工开物·乃服》“病症”条指出：“凡蚕将病，则脑上放光，通身黄色，头渐大而尾渐小。并及眠之时，游走不眠，食叶又不多者，皆病作也。”必须“急择而去之，勿使败群”。这种根据蚕体变态、行为反常和食欲不振来判断病蚕，并及时将它淘汰以免传染蔓延的做法，是符合科学原理的。