据记载，在张居正要求辞官时，他的整个身体都匍匐在地，而且泪流满面不肯起身。皇帝亲自走上前扶起他，并且当面下旨，让刘台终生在牢中度过。在皇帝的屡次劝说下，张居正依然不愿意接手朝政。最后，神宗皇帝只好派司礼监太监孙隆到张府宣读皇帝亲笔的手谕：“先帝以朕幼小，付托先生。先生尽赤忠以辅佐朕，不辞劳，不避怨，不居功，皇天后土祖宗必共鉴之。独此畜物为党丧心，狂发悖言，动摇社稷，自有祖宗法度。先生不必如此介意，只思先帝顾命，朕所倚任，保安社稷为重，既即出辅理，朕实伫望。”由于这篇手谕字字真挚，张居正便返回朝中继续理政。
最终，刘台被关进锦衣卫镇抚司监狱，虽然受尽各种折磨，但是刘台一直到最后都没有屈服。由于在动用了各种严刑之后，锦衣卫没有任何收获，因此只好上奏朝廷，提议对刘台进行廷杖，然后充军。
