第三，圣社发动由印度教正统派广为支持的保护母牛运动，把一个极为敏感的宗教问题带到政治斗争的旋涡中，造成了更大的混乱，引起了穆斯林更大的戒心。如印度历史学家指出的：“1890年早期，整个印度掀起了‘禁止屠杀母牛’的宣传活动，矛头主要针对的不是英国统治者，而是穆斯林，例如，英国军营里依然可以大规模地宰杀母牛。结果，这场运动总是转变成教派冲突，常常导致教派骚乱。1896年‘禁止屠杀母牛’运动慢慢平息下来，然而在20世纪20年代以更为猛烈的形式再次死灰复燃。”[11]国大党虽没有支持这种宗教要求，但它的某些成员参与了这个运动。
第四，19世纪90年代，印度教徒和穆斯林之间又发生了语言问题的冲突。在联合省，印度教徒要求印地语也应该和乌尔都语一样被允许在法庭上使用。穆斯林坚决反对，认为这样降低了乌尔都语的地位。在殖民当局接受前者的要求后，穆斯林举行了一系列集会，表示激烈的抗议。所有这些冲突，严重影响了双方群众的情绪，再加上殖民当局的挑动，结果就是19世纪80—90年代在一系列城市开始发生印度教徒与伊斯兰教徒的大规模的流血冲突，双方伤亡都很大。穆斯林领导人与国大党的政见分歧已经演变为印度教与伊斯兰教两大宗教的群众对立。这种局面的形成给民族运动造成严重威胁。然而，对玩弄“分而治之”政策的英国殖民者来讲，这只不过是他们挑动宗教对立的第一步。